淋巴結腫大隨年齡可逐漸縮小，但易于發生自身免疫性疾病。由于脾功能亢進、嚴重的溶血性貧血和頑固性血小板減少癥而需要進行脾切除。但脾切除后要注意防止細菌性敗血癥。
主要是控制自身免疫性疾病和惡性腫瘤。短期大劑量激素對自身免疫性溶血性貧血、自身免疫性血小板減少、自身免疫性中性粒細胞減少有效，有時需長期激素治療，并聯合細胞毒性藥物；霉酚酸酯可緩解ALPS的淋巴細胞增生；西羅莫司能清除ALPS的DNT細胞，降低患腫瘤的風險；抗CD20單抗用于治療難治性B細胞增生、自身免疫反應和B細胞淋巴瘤；病情嚴重者可異基因骨髓移植。