1、尿道綜合征的一般治療
休息、利尿、熱水坐浴、下腹熱敷、理療及針刺治療等。
2、尿道綜合征的行為治療
包括心理治療及生物反饋治療。醫生需與患者進行耐心的交談，使患者對疾病能有正確的認識，并積極配合治療。
膀胱功能訓練是行為治療和生物反饋治療的重要內容，通過膀胱功能訓練能增強神經系統對排尿的控制能力，降低膀胱的敏感性，重建正常的排尿功能，從而緩解或消除尿頻及尿急癥狀。具體方法是白天鼓勵多飲水，進行其他勞作或休閑活動，分散對尿意的注意力。主動控制排尿時間，逐漸延長排尿間隔時間，適量配合有關藥物治療。
3、尿道綜合征的藥物治療
（1）α-受體阻滯藥 如阿夫唑嗪、萘哌地爾、特拉唑嗪、多沙唑嗪或坦洛新（哈樂）等口服。
（2）解痙鎮痛藥 抗膽堿類藥物如溴丙胺太林（普魯本辛）、山莨菪堿（氫溴酸山莨菪堿）；或選擇性平滑肌松弛劑如泌尿靈；毒蕈堿受體阻滯藥如舍尼亭等。
（3）鎂離子口服液 可以提高細胞外液鎂離子的濃度，降低逼尿肌的興奮性，使之處于舒張狀態，提高膀胱的順應性。
（4）鎮靜及抗抑郁藥 如阿普唑侖（佳樂定）或氟西汀（百憂解），有抗焦慮、抗抑郁的協同作用。
（5）抗生素 感染仍可能是本癥的基本因素，故仍主張在發作時，適當選用抗生素治療，但應避免長時間應用。
（6）局部封閉治療 常用封閉藥物如慶大霉素、地塞米松加入普魯卡因。可用于膀胱頸及近端尿道封閉，膀胱三角區封閉。
（7）雌激素 用于雌激素水平低下者，分全身用藥和局部用藥。常用尼爾雌醇每半月或1月1次；或己烯雌酚（5mg，1次/日）連用3周，停藥1周，酌情重復1療程；或替勃龍（利維愛）或己烯雌酚霜劑，外陰或陰道局部應用等。
4、尿道綜合征的外科治療
（1）尿道擴張 適用于不同程度包括無癥狀的尿道梗阻，在尿道黏膜麻醉下施行，每周1次，尿道擴張器號碼應逐漸增大直至F36，多數患者癥狀得到改善。如果治療中斷仍可再次出現排尿梗阻癥狀。
（2）尿道松解術 尿道狹窄經擴張術無效者，可在局麻下行此術，待傷口愈合后可配合使用每兩周1次的尿道擴張。手術去除尿道陰道膈間遠端1/2彈力組織索或多處環形切開彈力組織索，可降低尿道阻力。