本病的治愈率較高，但瘢痕形成極易造成嚴重的瓣膜變形和腱索增粗縮短，導致瓣口狹窄和（或）關閉不全（慢性心瓣膜病）。少數病例可由于瓣膜穿孔或腱索斷離而導致致命性急性瓣膜功能不全。
疣贅物內的病原菌可侵入血流，引起敗血癥，患者皮膚、粘膜和眼底常有出血點，這是由于血管壁受損，通透性升高所致。這種出血在臨床診斷上有一定意義。脾一般呈中度腫大，鏡下，脾單核吞噬細胞增生，脾竇擴張充血。由于碑功能亢進和草綠色鏈球菌的輕度溶血作用，患者常有貧血。
動脈性栓塞：瓣膜上的疣贅物頗易脫落，進入血流，可引起各器官的栓塞。動脈性栓塞最多見于腦動脈，其次為腎及脾動脈，冠狀動脈栓塞少見。由于栓子多來自血栓的最外層，不含微生物或者由于病原菌毒力弱在局部不能存活，因此多引起非感染性梗死。