1.抗生素治療
選用敏感的抗生素是治療沙雷菌肺炎的關鍵，近幾年來沙雷菌耐藥株已明顯增多，且為多重耐藥，曾對沙雷菌有效的抗生素如慶大霉素，氨芐西林，阿米卡星，頭孢噻吩等現已有耐藥現象。但國內用紙片法測定藥敏結果表明，慶大霉素，阿米卡星，哌拉西林和頭孢噻吩對沙雷菌仍顯示較強的抗菌活性。第3代頭孢菌素及喹諾酮類抗菌藥物對沙雷菌仍有強大抗菌活性。臨床應用抗生素時應以藥敏為依據，選用叁代頭孢菌素或喹諾酮類，在藥敏之前經驗性治療可用阿米卡星聯用一種叁代頭孢菌素或喹諾酮類抗菌藥物。
廣譜青霉素與β-內酰胺酶抑制劑可用于治療沙雷耐藥菌株，復方替卡西林、哌拉西林/叁唑巴坦、亞胺培南/西司他丁鈉，為了提高抗生素治療效果，在沙雷菌肺炎應用抗生素時應注意以下幾點：①詢問患者本次生病是否已用抗生素，其劑量，名稱，療程和療效，以了解有無耐藥可能。②應定期查藥敏，以便及時發現耐藥現象及更換抗生素。③療程宜長，特別是對于醫院獲得性嚴重感染者宜3～4周，用量要足，宜聯用兩種抗生素靜注，但要注意肝腎功能。
2.對癥治療
促進排痰保持呼吸道通暢，糾正缺氧，要鼓勵患者咳痰，必要時霧化吸入，并給支氣管擴張劑，祛痰劑，吸氧糾正呼衰，保護心、腎、腦、肝功能，防治多臟器衰竭。
3.積治療原發病及并發癥，加強營養及支持治療
要積極治療原發病及各種并發癥，補足患者所需能量，適當輸新鮮血漿，人血白蛋白，人血丙種球蛋白，粒細胞，近年來有報道用鼠單克隆抗體E5拮抗內毒素。