治療著重改善通氣、給予氧療支持。
1.清理呼吸道
有羊水胎糞污染且宮內窘迫的新生兒，需立即評估其有無“活力”，“無活力”即無呼吸或喘息樣呼吸，肌張力低下，和（或）心率<100次/分鐘。在分娩后呼吸出現前，應立即進行氣管插管吸引。注意吸凈胃內容物，避免誤吸。有活力患兒需監護是否出現呼吸困難、青紫等表現。
2.監測和觀察項目
監測體溫、呼吸、心率、血壓、尿量、氧飽和度。密切觀察呼吸窘迫癥狀和體征，減少不必要的刺激。X線胸片監測肺部病變，注意有無并發氣胸或縱隔氣腫。
3.氧療
根據缺氧程度進行氧療，輕者選擇鼻管、頭罩給氧。嚴重時可用持續氣道正壓（CPAP）治療，壓力不宜太高。
4.對癥支持治療
注意保暖、鎮靜，熱卡供應，維持血壓、血糖、血鈣正常、糾正酸中毒等。保證入量，適當限制液體。注意胸部物理治療，定時翻身、拍背、吸痰，尤其對機械輔助呼吸者。
5. 使用肺表面活性物質
應用后6小時及24小時可顯著提高血氧合狀態，早期應用可降低氣漏的發生，改善氧合，縮短應用機械通氣的時間。
6. 應用抗生素
常需要選擇廣譜抗生素進行治療，積極尋找細菌感染的證據（血培養、氣管分泌物培養等），以確定抗生素治療的療程。