（一）輕癥病例應加強護理，對癥治療，保證液體和電解質的攝入，并注意隨訪。
（二）出現明顯腸道癥狀者應選用抗菌藥物治療，可選擇阿莫西林/克拉維酸等抗菌藥物，并根據藥敏試驗結果進行調整；可同時應用腸粘膜保護劑和微生態制劑。
（三）重癥病例可選用頭孢他啶、頭孢吡肟、美洛培南等進行抗菌治療，并根據臨床治療效果和藥敏試驗結果進行調整。應加強對癥支持治療；壞死性小腸結腸炎患兒要禁食，腹脹嚴重者要給予胃腸減壓，必要時外科手術治療；腦膜炎患兒給予鎮靜、止驚、降顱壓及針對并發癥的治療；有休克表現時及時給予抗休克治療。