LC-MS可以通過采集質譜得到總離子色譜圖。由于電噴霧是一種軟電離源,通常很少或沒有碎片,譜圖中只有準分子離子,因而只能提供未知化合物的分子量信息,不能提供結構信息。很難用來做定性分析,可以用來定量分析。但單級MS如果不用軟電離源,而是EI之類的話,就有碎片峰,可以提供分子結構信息。
LC-MS/MS采用串聯質譜,既能得到分子離子峰,又有碎片離子峰,因而可以用來進行定性和定量分析。
一個基本相似之處是:他們的應用領域都適用于液相適用的領域。
質譜的最大特點是:它本身是有質量信息的,是可以靠這個質量信息定性或提供定性的一些依據的(還需要其它的一些定性儀器)。其次,質譜本身也有一個分離作用,就是按照質量的分離,如果液相分離了一次,那LC-MS就分離了兩次,而LC-MS/MS就分離了三次,LC-MS3就分離了四次....(3級以上是離子阱質譜的特點)。
LC-MS和LC-MS/MS(或MSn)的最大區別是:如果你關心的結果是你樣品中的主成分,而且是你已經知道的目標物,比如質控、有機合成后看一下純品、部分的農藥全分析工作、藥物合成中前導化合物的指導(合成一鍋就打一針看看合成得對不對)等等,都可以用LC-MS。因為它很便宜,操作也很簡單。即時有些東西液相沒分開,但只要你關心的是主成分,影響都不大。通過調整一下液相條件,或做完掃描圖直接看提取離子圖,或做SIM都可以。這些領域用LC-MS/MS是大材小用,花這么多錢是浪費。
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