目前痰培養已然成為臨床標本送檢的主要類型，甚至占臨床總標本數的一半以上；但是痰標本培養是否能夠真正反映出患者的感染情況，請看本文詳解。
呼吸道、泌尿道、消化道是人體相對開放的3大通道，易被外界致病原侵入而發生感染。其中呼吸道感染是社區甚至院內感染最常見且危害最大的一類感染，通常呼吸道感染可分布于全院各科室，而呼吸道感染往往也是慢性腎功能不全、腦卒中及惡性腫瘤等非感染性疾病患者的直接死亡原因。
呼吸道感染的微生物學檢查方法很多，包括涂片、培養、抗原/抗體滴定及DNA監測等，其中，痰標本培養因其操作簡便、標本易于獲得等優點被廣泛使用，但值得注意的是，痰標本培養也存在著諸多的局限性。
1、痰標本培養一般需要48—72h，報告時間長，不利于臨床采取及時針對性的治療措施，尤其是重癥肺炎需要及早進行治療，若起始恰當治療延誤，則病死率將明顯增高。
2、社區獲得性肺炎（CAP）患者通常只有30%左右可獲得有意義的痰培養結果，且相當一部分結果與真實致病原可能并不一致。有研究表明，對痰檢查陽性的CAP患者行經胸壁針吸活檢取標本檢測致病菌，兩者一致率僅為44%。
3、若標本采集前應用了抗菌藥物，則將降低肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌等苛氧菌的分離率；此外，厭氧菌也是肺膿腫、膿胸、老年患者或腦卒中患者的重要致病菌，但常規培養一般分離不到厭氧菌。
4、實驗室報告的細菌培養陽性結果，很多情況下難以排出細菌定植或污染。
5、痰標本培養發現不同病原體的意義不同，如檢測到支原體、肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌及曲霉等時具有較高的診斷價值，而嗜麥芽假單胞菌則有可能是應用碳青霉烯類抗生素后定植菌的移行狀態。
6、建立人工氣道的患者，其下呼吸道不可能絕對無菌，常常會有細菌定植，應根據臨床表現來判定，不能查到細菌便認定為感染，進行針對性治療。
對同一種疾病，不同國家和地區，其致病原組成與耐藥特征會有較大的不同，所以感染性疾病的診治不能照抄指南，不能盲目的依賴微生物學結果，而是應結合臨床表現，參照依據循證醫學制定的本地區致病原流行病學資料與耐藥特點來選擇藥物。
特別作為院感專職人員，我們目前亟需關注的，除了常規的病原微生物送檢率外，更重要的是給臨床醫務人員提供所在地區真實可靠的社區（醫院）感染主要病原微生物及其耐藥特征，以向臨床醫生的經驗性治療提供科學的依據。