液液分配色譜儀原本是基于樣品分子在包覆于惰性載體（基質）上的固定相液體和流動相液體之間的分配平衡而實現分離，因為固定相液體容易溶解到流動相中去，所以重現性很差，不大被采用。后來發展起來的鍵合固定相通過化學鍵合將功能分子結合到惰性載體上，固定相液體不會溶解到流動相中。鍵合固定相是當今液相色譜儀zui常用的固定相，大約占液相色譜儀固定相的四分之三。
一、極性鍵合固定相：
鍵合在載體表面的功能分子是具有二醇基、醚基、氰基和氨基等極性基團的有機分子。
二、非極性鍵合固定相：
鍵合在載體表面的功能分子是烷基和苯基等非極性有機分子。最常用的ODS柱或C18柱，它是將十八烷基三氯硅烷通過化學反應與硅膠表面的硅羥基結合，在硅膠表面形成化學鍵合態的十八烷基，其極性很小。
三、正相液液分配色譜：
由極性固定相和非極性（或弱極性）流動相組成的液相色譜體系。其代表性的固定相是改性硅膠和氰基柱等，代表性的流動相是正己烷。
四、反相液液分配色譜：
由非極性固定相和極性流動相組成的液相色譜體系。其代表性的固定相是十八烷基鍵合硅膠，代表性的流動相是甲醇和乙腈。反相液液分配色譜是當今液相色譜的最主要分離模式，幾乎適用于所有能溶于極性或弱極性溶劑中的有機物的分離。