液相色譜儀常用的脫氣方法有如下幾種：
吹氦脫氣法
使用在液體中比空氣溶解度低的氦氣，在0.1MPa壓力下，以約60ml/min流速通入流動相10-15min以驅除溶解的氣體。此法適用于所有的溶劑，脫氣效果較好，但在國內因氦氣價格較貴，本法使用較少。
加熱回流法
此法的脫氣效果較好。
抽真空脫氣法
此時可使用微型真空泵，降壓至0.05~0.07MPa即可除去溶解的氣體。顯然使用水泵連接抽濾瓶和G4微孔玻璃漏斗可一起完成過濾機械雜質和脫氣的雙重任務。由于抽真空會引起混合溶劑組成的變化，故此法適用于單一溶劑體系脫氣。對多元溶劑體系，每種溶劑應預先脫氣后再進行混合，以保證混合后的比例不變。
超聲波脫氣法
將欲脫氣的流動相置于超聲波清洗器中，用超聲波振蕩10-15min。但此法的脫氣效果zui差。
在線真空脫氣法（on line degrasser）
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