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  • 發布時間:2024-06-07 15:51 原文鏈接: 清華大學儀器共享平臺Harmony數據分析工作站

    儀器名稱:Harmony數據分析工作站
    儀器編號:A23000084
    產地:英國
    生產廠家:PerkinElmer
    型號:Operetta CLS
    出廠日期:20230928
    購置日期:20230928


    所屬單位:醫研院>生物醫學測試中心>細胞生物學平臺>細胞平臺光鏡機組
    放置地點:醫學科學樓C119
    固定電話:010-62799145
    固定手機:
    固定email:
    聯系人:汪晶晶(010-62799145,18514213047,sapphireking@mail.tsinghua.edu.cn)
    孫悅(010-62799145,13121649797,sunyue@mail.tsinghua.edu.cn)
    分類標簽:圖像處理 高內涵分析 數據分析 Harmony
    技術指標:
    1. 38個預制分析模塊:如細胞計數或核計數、活/死細胞計數、質膜標志物定量、胞質向核轉位、胞質向膜轉位、Spot分析、有絲分裂指數、細胞周期分類、神經細胞分析、脂滴形成分析、亞細胞結構分割、表型分析、神經生長、在線質量控制、紋理分析、3D微組織分析、細胞軌跡追蹤等;

    2. 紋理分析功能:Kernel,Region,Indensity,Unnormalized等;

    3. 機器自學習模塊:用戶教導軟件識別不同的細胞類群或區域,創建自定義的分析算法,可自學習細胞大小、形態、亞細胞結構,組織形態結構,信號分布差等參數;

    4. Star分析功能:由軟件對圖像進行自主分析,無需任何人工干預,幫助使用者找到最合適的分析方法。形態學參數不低于200個;

    5. 預設分析方案數據形式:可針對每孔數據導出統計學數據,細胞實驗可導出每一單細胞數據,以便獲取細胞異質性信息;

    6. 參數優化功能:可以手動優化分割參數,也可以由軟件自動給出最佳參數(Turning優化法);

    7. 支持多種數據類型的導出:除可分析并導出整孔數據,同樣可以給出單視野,單細胞的各種參數。

    知名用戶:暫無
    技術團隊:

    汪晶晶 工程師,多年從事光學顯微成像工作。

    技術專長:

    1.激光共聚焦顯微鏡成像技術

    2.組織全景掃描成像技術

    3.熒光光鑷技術

    4.活細胞顯微成像技術

    孫悅 工程師,細胞生物平臺光鏡機組負責人,多年從事光學顯微成像工作。

    技術專長:

    1. 激光共聚焦顯微鏡成像技術

    2.組織全景掃描成像技術

    3.受激發射損耗超高分辨顯微成像技術

    4.熒光壽命成像技術

    功能特色:
    1. 豐富的3D可視化功能,提供最大光強重建視圖,XYZ多層切正交視圖,多種3D重建渲染視圖,任意角度層切視圖、多層細胞定位視圖。

    2. 各種視圖下的3D數據分析:通過智能視窗功能對感興趣區域確認分析參數,通過已確認的分析參數進行批量圖像分析。

    3. 可計算細胞體積、3D表面積、3D最大截面積、3D球形程度 、3D投影面積、3D球形內徑、3D 球厚度及高度等參數。

    4. 可計算3D位置參數:軟件可批量計算3D球彼此距離、找到最近距離的3D球以及3D球與孔邊緣距離、細胞在球體內的XYZ坐標參數以及群組細胞的3D共定位比例等。

    5. 多種3D微組織分區分析方式:可計算3D囊腫部及空腔區體積、3D肝組織內部空泡及肝實質區、3D 球體中陽性細胞到某球體邊緣或半球邊緣距離等,可批量導出單細胞數據、球體數據及整孔數據。

    6. 3D細胞紋理功能:可提供不少于6種的3D紋理學指標計算方式,提取紋理學參數重建的3D圖像,批量導出單細胞數據、球體數據及整孔數據。

    樣品要求:

    無。


    預約說明:

    1. 所有大型儀器均可通過點擊“儀器設備”,查看儀器設備聯系人信息,可通過電話及郵件聯系。

    2. 預約需至少提前12小時,預約后如有特殊原因無法按時使用儀器,請提前18小時取消預約。若超過取消時限或未取消預約的,按預約機時收費。

    3. 儀器未經預約不得私自使用。預約時間的最小單位為半小時,不足半小時或超過十分鐘以上(含十分鐘)按半小時記。本人預約本人使用,不得借用他人賬號預約使用儀器。若發現該情況將取消借出人賬號及權限。

    4. 實驗結束請通知平臺工作人員實驗結束,填寫實驗登記并上交樣品登記表。清理自帶的儀器設備。儀器使用記錄需如實填寫,若出現故障在故障排除后要進行登記。

    5. 未經過培訓與考核的同學可以使用自己的賬號預約工作時間的輔助測試(周一至周五8:30-17:00),備注請注明:姓名、課題組、手機號、實驗內容。第一次做實驗的同學請盡量提前聯系工作人員討論實驗細節,電話:62799145。

    項目名稱計價單位費用類別價格備注
    測試費元/小時自主上機機時費240.0


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