近期,來自加州大學洛杉磯分校、清華大學生科院與日本、比利時等處的研究人員,發表了題為“Crystal structure of a LacY–nanobody complex in a periplasmic-open conformation”的文章,報道了在無糖狀態下一個LacY ww –Nb 9039復合物的X射線晶體結構。相關成果公布在10月19日的《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志上。文章的通訊作者是加州大學洛杉磯分校生理學家H. Ronald Kaback,清華大學生科院顏寧教授也參與了此項研究。
這是今年下半年顏寧在Cell、Research、Nature和Science發表兩篇論文以來又一項重要學術成果。7月份,顏寧教授帶領的研究小組,與劍橋生物醫學院的研究人員證實,蘭尼堿受體1(RyR1)的中央結構域是遠距離變構門控通道開放的傳感器。這一研究發現發布在7月29日的《Cell Research》雜志上。
8月31日,國際著名期刊《Nature》在線刊登了顏寧課題組與北京生命科學研究所合作的一項重要成果,題為“Structure of the voltage-gated calcium channel Cav1.1 at 3.6 ? resolution”。這項研究在3.6?的標稱分辨率上,解析了兔Cav1.1復合物的冷凍電子顯微鏡結構。
9月22日,國際著名期刊《Science》在線刊登了顏寧教授課題組和加拿大卡爾加里大學的一項重要成果,題為“Structural basis for the gating mechanism of the type 2 ryanodine receptor RyR2”。這項研究采用單顆粒低溫電子顯微術,解析了2型蘭尼堿受體(RyR2)門控機制的結構基礎。
發表在《PNAS》上的這項新研究指出,大腸桿菌乳糖滲透酶(LacY)是一個動態的多面體膜蛋白,可催化半乳糖苷–H +同向轉運,并通過一種交替通路機制起作用,該通路呈現出多個構象,它的分布可隨著糖結合而變化。該研究小組此前針對一個向外(周質)開放的構象中的一個突變體已經開發了單域camelid納米抗體(Nbs),來穩定蛋白的這種狀態。
在這項研究中,該研究小組描述的是一個雙Trp突變(Gly46→Trp/Gly262→Trp)和一個NB之間的一個復合物的X射線晶體結構,在其中觀察到了從周質腔到糖結合位點的自由出入。結構確認了生化數據,表明Nb可以納摩爾級的親和力,結合到LacY的周質表面,主要是C-末端的六螺旋束。
這種結構很新穎,因為進入糖結合位點的通路是狹窄的,含有半乳糖苷結合位點的中央腔是空的。雖然Phe27可使周質腔變窄,但是糖可自由出入該結合位點。值得注意的是,當結合糖存在或缺乏時,直接參與結合半乳糖苷的側鏈仍然位于同一位置。
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