HUS的腎外損害廣泛，有的威脅生命，但隨著治療手段的改進，病死率已降至10%以下，存活者中有持久和嚴重的腎外后遺癥者僅約5%。
1.消化系統病 除前邊述及的腸道表現外還可有：①胰腺疾患：胰腺的病理損害也是由血栓性微血管病(TMA)引起，可導致胰腺內，外分泌不足，但有胰腺炎臨床表現者并不多，而4%～15%患者可表現出暫時性或永久性糖尿病。②肝臟疾患：可見肝大和轉氨酶增高，偶爾發生膽汁淤積性黃疸，未見慢性肝損害與肝功衰竭之報道，肝活檢可見小血栓，未發現有肝壞死。③膽囊疾患，可發生膽石癥，與快速溶血形成膽紅素鈣鹽結石可能有關。
2.中樞神經系統損害 表現多樣，有易激惹，嗜睡，焦慮，也可有幻覺，妄想，木僵甚至昏迷等不同程度的意識障礙，檢查可見震顫，驚厥，反射亢進，共濟失調，巴氏征(+)及腦神經損害等，腦脊液蛋白定量增高，CT與MRI檢查能確定損害的性質和位置。
3.循環系統損害 可見到心肌炎，心肌梗死，心力衰竭。
4.呼吸系統損害 有肺水腫或出血性浸潤，尸檢能發現肺部微血栓者要比臨床有顯著原發肺損害者人數多。
5.其他 如皮膚淤斑，口唇皰疹也有發生，HUS患兒尸檢中發現腎上腺，甲狀腺，胸腺，淋巴結，膀胱和卵巢的微血管系統有血栓，但尚未見與這些解剖損害相關的器官功能障礙報道。