1. 將清潔好的濾菌器、濾瓶分別用紙或布包裝好，高壓蒸氣滅菌。2. 以無菌操作將濾菌器和濾瓶裝好，并使濾瓶的側管通過緩沖瓶與抽氣機連接。3. 將待濾液體倒入濾菌器內，開動抽氣機。4. 濾菌結束后，迅速以無菌操作將濾液放到無菌容器中備用。5. 用過的濾菌器須經高壓蒸氣滅菌后洗凈備用。
