肺炭疽
采集血液（有胸腔積液患者可采集胸腔積液，有腦膜炎癥狀患者可采集腦脊液）進行革蘭染色培養和PCR檢測；急性期和恢復期可進行血清學檢測；胸膜及支氣管活檢。
皮膚炭疽
采集破損皮膚組織進行革蘭染色、培養和PCR檢測；組織活檢；急性期和恢復期可進行血清學檢測；有全身感染癥狀患者可進行血培養。
腸炭疽
采集嘔吐物或（和）排泄物進行革蘭染色、培養和PCR檢測；急性期和恢復期可進行血清學檢測；有全身感染癥狀患者可進行血培養。通過培養分離出炭疽桿菌是診斷的“金標準”，PCR、免疫組化活檢和血清學檢測僅作為輔助手段，若3種方法均為陽性，可確診；3種方法2種陽性，或1種陽性且有暴露史，作為疑似病例。