聚合物在高溫下進行裂解，裂解產物被載氣導出裂解室后進入GC的進樣口，由此進入GC/MS系統。熱裂解器目前常用的為三種裝置，即熱絲裂解器、管爐裂解器以及局里點裂解器，各種裝置各有利弊。但是，從形成有特征性強的裂解譜圖，又有高的重復性的角度看，裂解器應當追求如下的主要目標：升溫速度快；減緩升溫過程中所發生的連續分解；高溫區裂解產物的二次反應要小，能快速導人樣品和快速將裂解產物導出高溫區；使裂解產物的剖面清晰，譜圖易于解析；裂解溫度的調節和精確控制容易實現，使用方便且易清凈；死體積要小于減小裂解產物色譜峰的加寬。
熱裂解器三個主要指標介紹：
1.裂解溫度
裂解溫度過低或者過高都難以形成反映高聚物結構的裂解產物特征譜。這固然要通過實驗（一般以500℃開始）去摸索，使樣品達到瞬間的完全裂解。當然一般推薦的溫度為400-900℃，其中500-600℃是對大多數高分子化合物都比較適宜的最佳溫度。有關各類高聚物的最佳裂解溫度可以參考拓植新等人的著作。
2.樣品量
高分子材料本身是熱的不良導體，因此如何使樣品瞬間受到均勻的加熱溫度并能發生裂解這是實驗中應當注意的問題。GC/MS的檢測靈敏度通常在ng數量級，考慮到實驗中的分流比，樣品量在1-100ug足夠了，小于10ug是一般推薦值。過多的量不僅導致一部分樣品不能在預定的熱解溫度下分解，而且因為是非瞬間的氣化而留有較多的殘渣于裂解室內，影響下一個樣品的分析。通常將樣品溶解在溶劑中，然后加到樣品導入裝置中以形成薄膜，這是最為理想。如果高聚物是不溶解的，則需研磨成極細的粉末并均勻鋪放。
3.裂解室的清凈
附在裂解器壁上的碳化物或者影響熱的傳導或者起催化裂解作用。對于直立式結構的裂解器，還要當心裂解后的殘留物跌落在氣相色譜進樣口的可能。