琥珀酸脫氫酶是連接氧化磷酸化與電子傳遞的樞紐之一，可為真核細胞線粒體和多種原核細胞需氧和產能的呼吸鏈提供電子，其活性一般可作為評價三羧酸循環運行程度的指標。 該酶以FAD作為其脫下電子的受體，而不是NAD+。琥珀酸脫氫酶與FAD的關系是以共價鍵相互連接，因此它是酶和輔基的關系。很特別，因為一般FAD與酶以非共價鍵形式結合。盡管琥珀酸脫氫酶的作用是專一的，但丙二酸（與底物結構上很相似）可以與該酶結合，但酶不能催化其脫氫，因此丙二酸是琥珀酸的強抑制劑。琥珀酸脫氫酶催化琥珀酸的脫氫具有嚴格的立體專一性。
琥珀酸脫氫酶與檸檬酸循環中的其它酶不同，是唯一嵌入到線粒體內膜的酶，是線粒體內膜的一個重要部分，其它酶大多存在于線粒體的基質。
琥珀酸脫氫酶線粒體三羧酸循環
琥珀酸脫氫酶（Succinatedehydrogenase，簡稱SDH），黃素酶類，是線粒體內膜的結合酶，屬膜結合酶，是連接氧化磷酸化與電子傳遞的樞紐之一，可為真核細胞線粒體和多種原核細胞需氧和產能的呼吸鏈提供電子，為線粒體的一種標志酶。作為參與三羧酸循環的關鍵酶，琥珀酸脫氫酶是反映線粒體功能的標志酶（markerenzyme）之一，其活性一般可作為評價三羧酸循環運行程度的指標，對于評價精子線粒體功能、研究致奶牛酮缺乏癥病理過程等具有重要意義。