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  • 發布時間:2021-05-22 16:44 原文鏈接: 瓊脂糖凝膠電泳之二實驗步驟及注意事項

    實驗步驟

    一、試劑配制


    1.  5×TBE緩沖液:450 mmol/L Tris-硼酸,10 mmol/L EDTA,pH值8.0。使用時將上述儲存液稀釋10倍至0.5×TBE緩沖液,可同時作為電泳及制膠用的緩沖液。
    二、制膠
    1.  根椐制膠量及凝膠濃度,在加有一定量的電泳緩沖液的三角錐瓶中,加入準確稱量的瓊脂糖粉(總液體量不宜超過錐瓶的50%
    容量)。瓊脂糖粉末與0.5×TBE buffer的比例(w:v)參考表1,常用瓊脂糖濃度為0.7-1%。

    表1  瓊脂糖凝膠濃度與線形DNA的最佳分辨范圍

     

    瓊脂糖濃度 最佳線形DNA分辨范圍(bp)
    0.50%  1 000~30 000
    0.7%   800~12 000
    1% 500~10 000
    1.20% 400~7 000
    1.50% 200~3 000
    2% 50~2 000
    2%~5% 20~1 000

     

     


    2.  在錐瓶的瓶口上蓋上保鮮膜或牛皮紙,并在膜或紙上扎些小孔,然后在微波爐中加熱溶解瓊脂糖。加熱時,當溶液沸騰后,請戴上防熱手套,小心搖動錐瓶,使瓊脂糖充分均勻溶解。此操作重復數次,直至瓊脂糖完全溶解。

    3.  使溶液冷卻至50℃-60℃左右,如需要可在此時加入溴化乙錠溶液(終濃度0.5  μg/ml)或按照1 μL / 30 mL的比例加入DNAgreen染料,并充分混勻。
    4.  將瓊脂糖溶液倒入制膠模中,然后在適當位置處插上梳子。凝膠厚度一般在3~5 mm之間。制膠模如下圖所示,小膠倒入25-30 mL左右瓊脂糖溶液,大膠則60-70 mL左右,若需切膠回收,凝膠可適當加厚。

    5.  在室溫下使膠凝固,大約30分鐘~1小時。
     

    三、上樣
    1.  取適量樣品與6×上樣緩沖液混勻(如:1 μl樣品與5 μl 6×上樣緩沖液),用微量移液槍小心加入樣品槽中。
    2.  上樣量根據樣品濃度可適當調整,若DNA含量偏低,則可依上述比例增加上樣量,但總體積不可超過樣品槽容量(一般小孔40 μl 為上限,大孔200 μl 為上限,具體和制膠膜規格相關)。
     
    3.  每加完一個樣品要更換槍頭,以防止互相污染,注意上樣時要小心操作,避免損壞凝膠或將樣品槽底部凝膠刺穿。

    四、電泳

    1.  加完樣后,合上電泳槽蓋,立即接通電源。控制電壓保持在110 V,電流在40 mA以上。

    2.  當條帶移動到距凝膠前沿約2 cm時(約40 min),停止電泳。

    3.  紫外下拍照并觀察。


    注意事項

    1.  5×TBE緩沖液放置時間過久會沉淀,因此一次性不要配太多。工作用電泳緩沖液為0.5×TBE緩沖液,取5×TBE緩沖液貯存液稀釋,現配現用。

    2.  用于電泳的緩沖液和用于制膠的緩沖液必須統一。

    3.  瓊脂糖粉在微波爐中加熱時間不宜過長,每次當溶液起泡沸騰時停止加熱,否則會引起溶液過熱暴沸,造成瓊脂糖凝膠濃度不準,也會損壞微波爐。溶解瓊脂糖時,必須保證瓊脂糖充分完全溶解,否則,會造成電泳圖像模糊不清。

    4.  凝膠不立即使用時,請用保鮮膜將凝膠包好后在4℃下保存,一般可保存2~5天。
     


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