工業生物技術在生物煉制中起著非常核心的作用，從基礎研究的角度得到重視。我國的"973"項目中，和生物煉制相關的就有四個，方向比較明確的是三個，第一個項目啟動是在2004年，當時生物煉制這個概念在國內還沒有，國外也是剛剛出現這個名詞。
2006年的"973"項目—— 生物煉制細胞工廠的科學基礎是在國內第一次把生物煉制的概念明確提出來。在生物煉制過程中，生物原料轉化為化學產品，其核心部分是微生物，需要對微生物進行全方位改造。雖然自然微生物的能力強，但自然界的微生物不是為工業生產需要而設定的，所以必須對它進行改造，這一項目的目的就是做改造微生物細胞本身的工作，把微生物細胞變成一個工廠，重建自然生產線就是這一項目的主要任務。而2007年立項的"973"項目是生物煉制研究的延續，不是指內容的延續，是研究范疇的銜接。
2006年的項目定位在微生物本身細胞性能的改造，2007年"973"項目主要是過程的控制，如何實現個性化的制造，獲得工業可放大的參數，實質解決的是過程工程的問題，以及如何在這個過程中實現節能降耗。還有一個項目就是化學法生物煉制"973"項目，是由浙江大學和中國科技大學聯合主持的利用生物質作原料通過熱化學法的生物煉制。
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