類黃酮在植物界中分布很普遍,已發現的天然類黃酮有2000多種,類黃酮在藻類、菌類中很少發現,苔蘚植物大多含有類黃酮,裸子植物中也含有類黃酮,但類型較少,主要為雙類黃酮；類黃酮成分最集中的是被子植物,其中豆科、薔薇科、蕓香科、傘形科、杜鵑花科、報春花科、唇形科、玄參科、馬鞭草科、菊科、蓼科、鼠李科、冬青科、桃金娘科、桑科、大戟科、尾科、蘭科、莎草科和姜科尤為富集。含有類黃酮的常用中藥有槐米、黃芪、葛根、陳皮、枳實、銀杏葉、山楂、菊花、野菊花、淫羊藿、射干等。而動物和人類日糧中的豆類中類黃酮含量較多。主要是大豆異黃酮及其糖苷。
水果中生物類黃酮的來源包括蘆丁（蕎麥中含量很高,苦蕎含量又是普通蕎麥的10多倍）以及橙皮苷,主要存在于柑橘類水果中。最好的食物來源是野玫瑰果、蕎麥葉、柑橘類水果、漿果、椰菜、櫻桃、葡萄、木瓜、哈密瓜、李子、茶葉、紅酒以及番茄。黃瓜中也含有特殊的生物類黃酮,它可以阻止致癌的激素與細胞結合。
很多自然界食物中均含有一定量生物類黃酮,主要存在于柑橘類水果中,其中含量較高的是野玫瑰果、蕎麥葉、柑橘類水果、漿果、椰菜、櫻桃、葡萄、木瓜、哈密瓜、李子、茶、紅酒以及番茄。黃瓜含有一種特殊的生物類黃酮,它可以阻止致癌的激素與細胞結合。