• <noscript id="yywya"><kbd id="yywya"></kbd></noscript>
  • 發布時間:2019-09-10 12:01 原文鏈接: 用λ噬菌體PL啟動子在大腸桿菌中表達克隆基因實驗

               

    實驗材料

    載體和細菌菌株 PL 表達載體 陽性對照質粒

    試劑、試劑盒

    考馬斯亮藍染色溶液或銀染溶液 L-色氨酸 SDS 凝膠加樣緩沖液 SDS-聚丙烯酰胺凝膠 靶基因或 cDNA 片段 LB 瓊脂平板 LB 培養基 M9 基本培養基

    儀器、耗材

    SorvallGSA 轉頭或相當的轉頭 沸水浴 振蕩培養器

    實驗步驟

    材料

    緩沖液和溶液

    貯存液、緩沖液和試劑的成分參見附錄 1。
    貯存液稀釋至適當濃度。

    考馬斯亮藍染色溶液或銀染溶液
    參見附錄 8。

    1XSDS 凝膠加樣緩沖液
    不含 DTT 的 1xSDS 凝膠加樣緩沖液室溫保存,1mol/LDTT 貯存液現用現加于上述緩沖液。

    L-色氨酸(10 mg/ml)

    凝膠

    SDS-聚丙烯酰胺凝膠(10%)
    用于分離蛋白的 SDS-聚丙烯酰胺凝膠的制備參考附錄 8。

    核酸和寡核苷酸

    靶基因或 cDNA 片段

    培養基

    LB 瓊脂平板
    LB 培養基
    根據所用載體在培養基中加入不同的抗生素。

    加熱到 65°C 的 LB 培養基
    備選,參見步驟 13。

    M9 基本培養基
    滅菌后補加 0.5%(m/V) 葡葡糖,0.2%(m/V) 酪蛋白酸水解物和所需抗生素,用于色氨酸誘導的表達載體。

    離心機和轉頭

    SorvallGSA 轉頭或相當的轉頭

    特別配備

    沸水浴

    設定為 30°C 和 40°C 的振蕩培養器
    只有使用λ噬菌體 cI 基因的溫度敏感型等位基因時才需要。

    補充試劑

    本方案步驟 1 需要第 8 章方案 7 中所列試劑。
    本方案步驟 2 需要第 1 章方案 17 或 19 中所列試劑。
    本方案步驟 3 需要第 1 章方案 23~26 中所列試劑。
    本方案步驟 4 需要第 12 章方案 3 中所列試劑。

    載體和細菌菌株
    帶有λ噬菌體 cI 基因的 cIts857 等位基因或野生型等位基因的大腸桿菌菌株在 M5219 菌珠中是熱誘導的 clts857 等位基因,在 GI724 菌珠 (ATCC55151cI 基因)中是色氨酸誘導的野生型 cI 基因。

    PL 表達載體(如 pHUB,pPLc,pKC30,pASl,pCQV2,pAL-781 和 pTrxFus)

    陽性對照質粒(表達已知大小融合蛋白的 PL 表達載體)

    方法

    含重組表達載體的大腸桿菌菌株的構建

    1.PCR 修飾(第 8 章方案 7) 或限制性內切酶消化分離 DNA 片段,片段 5'端和 3'端帶有與 PL 表達載體對應的限制酶位點。
    必要時可在 cDNA/基因的 ATG 上游置入強的核糖體結合位點。
    為確定擴增反應沒有引入錯誤突變,應對 PCR 產物進行序列分析。

    2. 靶 cDNA/基因的 DNA 片段與表達載體連接(第 1 章方案 17 或 19)。

    3. 連接產物轉化含有 cIts857 等位基因或野生型 cI 基因的大腸桿菌菌株。將轉化體鋪于含相應選擇抗生素的 LB 平板(通常為 50ug/ml 的氨芐青霉素),于 30°C(含有cIts857 等位基因)或 37°C(含有色氨酸誘導的野生型 cI 基因)過夜培養。
    空的表達質粒轉化相同的大腸桿菌菌株作陰性對照。

    4. 通過菌落雜交和/或小量制備質粒的限制酶切分析、寡核苷酸雜交或序列分析篩選帶有插入片段的轉化體(請參見第 12 章方案 3)。

    誘導靶蛋白表達的優化
    許多研究表明細胞生長速率嚴重影響外源蛋白的表達,因此必須對接種細菌量、誘導前細胞生長時間和誘導后細胞密度進行控制。生長過度或過速都會加重細菌合成系統的負擔,導致形成包涵體。

    5. 通過提髙溫度或加入色氨酸,下調 cI 阻抑蛋白,誘導靶蛋白表達,篩選最佳表達條件。
    影響誘導表達的因素請參見方案 1 步驟 8 的注解。

    對于溫度誘導系統

    a. 對照菌和重組菌分別挑取 1~2 個菌落,接入 1 ml 含所需抗生素的 LB 培養液,30°C 培養過夜。
    編碼己知大小蛋白的表達載體作陽性對照。

    b. 取 50ul 接入 10 ml 含抗生素的 LB 培養液,在 50 ml 搖瓶中于 30°C 培養至對數中期(A550=0.5?1.0)。

    c. 吸出 lml 未經誘導的培養物放在一個微量離心管中,按下面步驟 6 和 7 所述進行處理。

    d. 調整溫度至 40°C, 誘導剩余培養物。繼續步驟 6。
    盡管在本書其他章節中采用 42~45°C 滅活λ噬菌體 cIts857 阻抑物,但此處采用40°C 以便減少熱激蛋白的誘導并使細菌能夠繼續生長。

    對于色氨酸誘導系統

    a. 含空載體和重組表達載體的大腸桿菌(帶有 cI 野生型等位基因)分別挑取 1~2個菌落,接入 1ml 補充 M9 培養液,37°C 培養過夜。
    編碼已知大小蛋白的表達載體作陽性對照。

    b. 取 50ul 接入 10 ml 補充 M9 培養液,在 50 ml 搖瓶中于 37°C 培養至對數中期(A550=0.5~1.0)。

    c. 吸出 1 ml 未經誘導的培養物放在一個微量離心管中,按下面步驟 6 和 7 所述進行處理。

    d. 剩余培養物中加入色氨酸至終濃度 100ug/ml,37°C 繼續培養。

    6. 誘導不同時間(如 1、2、4 和 6 h) 后取 1ml 樣品放于微量離心管中,測定A550, 室溫高速離心 1 min。

    7. 沉淀懸于 100ul 1XSDS 凝膠加樣緩沖液,100°C 加熱 3 min, 室溫高速離心lmin,冰上放置,待全部樣品處理完后上樣。

    8. 樣品加熱至室溫,取 40ug 或相當于 0.15 OD550 培養物的懸液上樣于 10%SDS 聚丙烯酰胺凝膠。

    9.8~15V/cm 電泳,至溴酚蘭遷移到分離膠底部。

    10. 考馬斯亮藍染色或銀染,或免疫印跡,觀察表達產物條帶(見附錄 8)。
    未轉化的大腸桿菌細胞和轉化了空載體的細胞,蛋白質帶形應該沒有區別。誘導一定時間的重組菌應有一條與預計大小一致的帶。

    大量表達靶蛋白

    11. 挑取一個重組大腸桿菌菌落接入 50 ml 含抗生素的 LB 培養液或補充 M9 培養液,
    在 250 ml 搖瓶中于 30°C 或 37°C 過夜培養。

    12. 取 50 ml 過夜培養物接入 450 ml 含抗生素的 LB 培養液或補充 M9 培養液,在 2L 搖瓶中于 30°C 或 37°C 振蕩培養至對數中期(A550=0.5~1.0), 按步驟 13 或 14 進行誘導。

    13. 加入 500 ml 加熱至 65°C 的 13 培養基,誘導帶 cIts857 等位基因的大腸桿菌。40°C培養預試驗確定的最佳時間。或者于室溫以 12000 g(8600r/min Sorvall 轉頭)離心 5 min 收集細胞,沉淀重懸于 500 ml40°C 的LB 培養基,40°C 繼續培養預試驗確定的最佳時間。

    14. 加入色氨酸至終濃度100ug/ml, 誘導帶 cI 等位基因的大腸桿菌。37°C 繼續培養預試驗確定的最佳時間。

    15. 誘導適當時間后,于 4°C 以 5000 g(5500r/min Sorvall GSA 轉頭)離心 15 min 收集細胞,繼續后面的純化方案:

    ? 如果表達的是 GST 融合蛋白,繼續方案 5

    ? 如果表達的是麥芽糖結合蛋白融合蛋白,繼續方案 6

    ? 如果表達產物帶有組氨酸標簽,繼續方案 7



                展開


    相關文章

    研究可視化觀察增強子和啟動子的動態運動控制基因活性

    盡管密集地排列在細胞核中,但儲存我們遺傳信息的染色體總是處于運動狀態。這使得染色體的特定區域能夠被接觸到,從而激活一些基因。在一項新的研究中,來自奧地利科技學院、美國普林斯頓大學和法國巴斯德研究所的研......

    啟動子和轉錄因子在動植物細胞中有不同的共演化模式

    近日,中國科學院分子細胞科學卓越創新中心研究員陳洛南團隊與西北工業大學教授王文團隊等在ZoologicalResearch上在線發表題為Coevolutionaryinsightsbetweenpro......

    啟動子和轉錄因子在動植物細胞中有不同的共演化模式

    近日,中國科學院分子細胞科學卓越創新中心研究員陳洛南團隊與西北工業大學教授王文團隊等在ZoologicalResearch上在線發表題為Coevolutionaryinsightsbetweenpro......

    雙向啟動子可以協調調控反向運行的基因

    新的分析發現,發散性轉錄(一個啟動子引導兩個相鄰基因向相反方向表達)在生命的所有領域都是保守的。與生物學教科書中描述的相反,細菌和古生菌可以在基因組上以相反的方向進行轉錄。這要歸功于雙向啟動子——RN......

    徐彥輝組揭示轉錄起始復合物識別啟動子及動態組裝機制

    4月1日,《科學》在線發表了復旦大學生物醫學研究院研究員徐彥輝課題組的一篇研究長文,首次報道了包含TFIID的完整轉錄前起始復合物(PIC)結構,揭示了PIC如何識別不同類型啟動子并完成多步組裝的完整......

    如何確定非編碼rna的啟動子?

    長鏈非編碼RNA(Longnon-codingRNA,lncRNA)是長度大于200個核苷酸的非編碼RNA。研究表明,lncRNA在劑量補償效應(Dosagecompensationeffect)、表......

    『合成生物』精準微調遺傳電路工具包

    他們創建了一個啟動子庫,其中富含許多模塊,每種模塊可以對一種或多種化學輸入做出特殊反應,通過自定義動態區間設計,實現內部代謝通量微調控制,甚至能構建出“無滲漏”啟動子操縱基因電路。“益生菌在很多方面影......

    爆炸性新聞:垃圾DNA的神秘力量

    置身于浩瀚基因組海洋中的遺傳控件們需要在恰當的時機被激活,才能玩轉復雜的人類生理特征發育。位于基因前端的啟動子序列必須精準地與增強子集團配對。為了成功接軌,遙遠的啟動子是如何靠近增強子的呢?如果雙方配......

    病毒和宿主細胞啟動子新認識有望開發出新的HIV治愈策略

    啟動子是基因的一個重要的組成部分,控制著基因表達(轉錄)的起始時間和表達的程度。在一項新的研究中,來自美國伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校的研究人員首次證實病毒和宿主在它們的啟動子上都具有高度類似的調節序......

    任兵教授利用CRISPR發現新型增強子

    人類基因組只有不到2%編碼蛋白質,因此解析非編碼DNA的功能是一個很大的挑戰。科學家們已經通過分析DNA甲基化、染色質修飾、核酸酶敏感性、轉錄因子結合,在人類基因組中預測了數百萬個調控序列,但只有少數......

  • <noscript id="yywya"><kbd id="yywya"></kbd></noscript>
  • 东京热 下载