治療目的是解除痛苦，保護腎功能，排出結石并防止復發。
1.診治腎絞痛 解痙止痛藥物如阿托品、溴丙胺太林(普魯本辛)和哌替啶(杜冷丁)，有時可用吲哚美辛(消炎痛)栓劑，口服硝苯地平(硝苯吡啶,心痛定)能直接松弛輸尿管平滑肌。
2.大量飲水。
3.中西醫結合治療 可服排石湯，對輸尿管結石有較好療效。
4.控制感染 應根據尿細菌培養、藥敏的結果，選擇合適的抗生素。
5.非手術治療
(1)體外震波碎石
①適應證：適用于腎、輸尿管及膀胱結石。
②禁忌證：
A.結石以下有梗阻者。
B.有出血性疾病的患者。
C.心力衰竭伴有嚴重心律不齊者。
D.腎功能不全由于腎實質疾病引起的患者。
③碎石時的體位：
A.腎結石可用仰臥位。
B.輸尿管上、中段結石采用向患側傾斜的體位。
C.輸尿管下段結石和膀胱結石采用俯臥體位。
D.輸尿管末端結石采用半坐位。
④合并癥：
A.血尿。
B.腎絞痛。
C.發熱。
D.皮膚損傷。
E.心臟合并癥：應嚴密監視，及時予以處理。
⑤治療后處理：
A.大量飲水，以利排石。
B.定期B超或腹部平片復查。
(2)腔內泌尿外科治療：
①經皮腎鏡取石術：經過皮膚穿刺造瘺，通過瘺口插入腎鏡可取出腎內或輸尿管上段結石。
A.小的結石直接用取石鉗取出。
B.較大的結石可用超聲波、液電或汽壓碎石，然后用水洗。
C.合并癥有出血和周圍臟器損傷。
②經尿道、輸尿管腎鏡取石術：
A.對于輸尿管內結石，可通過尿道、膀胱將細長輸尿管鏡入輸尿管內，在窺鏡直視下將結石取出，或用超聲波、液電或汽將結石擊碎，然后用水沖洗。
B.禁忌證：有尿道狹窄或前列腺肥大者不宜應用。
C.合并癥：輸尿管損傷和穿孔，術后發燒等。
③經尿道膀胱鏡取石術：
A.適用于膀胱結石或尿道結石。
B.在膀胱鏡直視下采用超聲波、液電、汽壓或直接用機械碎石。
C.禁忌證：有尿道狹窄和炎癥者不宜應用。
6.手術治療
(1)腎結石：老年患者一側腎有鹿角狀結石，若無臨床癥狀，通常可不必手術，但應密切隨診。若雙腎結石伴有腎功能損害或并發感染，則需手術治療。手術方法有：
①腎盂切開取石術。
②腎竇內腎盂切開取石術。
③腎實質切開取石術。
④腎部分切除術：位于腎下盞的結石和該處腎實質破壞時。
⑤腎切除：巨大腎結石合并感染或腎功能喪失、對側腎功能良好者。
(2)輸尿管結石：輸尿管切開取石術。根據結石位置采取不同的切口。
適應證：①反復發作腎絞痛，梗阻時間較長，B型超聲波或靜脈尿路造影顯示腎積水。②結石較大(＞1cm)，自動排出的可能性很小。③結石固定在某一位置不移動超過3周者。
(3)膀胱結石：切開膀胱取石術
適應證：①巨大膀胱結石合并感染；②膀胱結石合并前列腺增生癥，在切開膀胱取石術時，將肥大的前列腺也切除。③膀胱憩室內結石，同時切除膀胱憩室。