醫學和生物學研究：在醫學和生物學領域，甲苯胺藍常用于細胞核染色，幫助觀察和分析細胞核的形態特征。它還可以用于檢測真菌和原蟲等微生物，輔助診斷感染性疾病。此外，甲苯胺藍在神經生物學研究中也有應用，可以染色神經組織，幫助分析神經系統的結構和功能。
病理學診斷：在病理學檢查中，甲苯胺藍染色法常用于染色細胞核，幫助識別和區分不同類型的細胞。這種方法對于腫瘤診斷和分類尤為重要。
血液學研究：甲苯胺藍可以用于血液涂片的染色，幫助識別和分類不同類型的血細胞，包括在白血病的診斷中的應用。
外科手術：在某些外科手術中，甲苯胺藍可以作為標記染料，幫助外科醫生在手術過程中識別和區分不同的組織類型。
染色劑：作為一種染色劑，甲苯胺藍還用于其他科學和工業領域，對各種材料進行染色。
化學實驗：在化學實驗中，甲苯胺藍可以用作pH指示劑，根據溶液的酸堿性改變顏色。
教育用途：在教育領域，甲苯胺藍可以用于教學實驗，幫助學生理解染色原理和細胞結構。
紡織業：在紡織業中，甲苯胺藍可以用作染料，給織物著色。
環境監測：甲苯胺藍還可以用于環境監測，例如檢測水中的重金屬離子。
化妝品行業：在化妝品行業中，甲苯胺藍可以用作著色劑，給產品添加顏色。
攝影和印刷行業：在攝影和印刷行業中，甲苯胺藍可以用作成像劑，幫助形成圖像。
食品和飲料行業：在食品和飲料行業中，甲苯胺藍可以用作食品色素，給食品著色。