甲醛分子中只有一個碳原子，含有一個醛基，分子式為$CH_2O$，分子量為30。市面上雖然有多種形式的甲醛溶液出售，但它們含有少量的甲酸和甲醇，對被固定的樣品產生不良影響，適合電鏡固定使用的只有通過由多聚甲醛(paraformaldehyde)新鮮制備的甲醛溶液。甲醛溶液的毒性很大，即使是稀釋液也要格外小心操作。甲醛溶液對皮膚有硬化作用，長時間接觸可能導致皮膚破裂、皮炎或是過敏癥狀；甲醛極易揮發，它對呼吸道也有影響，長時間暴露在甲醛氣體中會使嗅覺敏感度降低；此外甲醛對眼睛也有影響，而且還被認為是致癌物質。因此在操作甲醛粉末或溶液時都必須很小心，帶上手套并在通風櫥中進行。少量廢棄的醛類試劑（甲醛、戊二醛和丙烯醛等）可以直接在大量流水沖稀的情況下倒進水池內（但要注意有關部門的有關規定），當然少量的醛類試劑與過量的1M甘氨酸混合后，再在大量流水沖稀的情況下倒進水池，會更安全。通常100ml的甲醛(1%)需要50ml的1M甘氨酸，100ml1%戊二醛則需要35ml，而丙烯醛需要40ml。大量的醛類試劑必須集中回收處理。