1、ISE的直接法和間接法的區別在于直接法未作稀釋直接測定,間接法預先稀釋后測定,但是兩種方法測定的都是離子活度.
2、比較ISE法與火焰光度法之間是存在偏差的，ISE法偏高，造成這種差異的原因是：火焰法測定的是血漿中的鈉、鉀濃度；而電 極法測定的是血漿或是血清水中的鈉、鉀濃度。電極法摒棄了樣品中蛋白質和脂類等大分子所占體積，也就是稱為基質效應，導致了電極 法的結果偏離。對于ISE法中的直接法與間接法來說，間接法將樣品稀釋了，其中水體積所占比例改變對結果又產生了影響，使結果有 一定偏差。上述偏差都是一個比例偏差和恒定偏差都可以通過建立直線回歸方程來補償，而且這個補償系統在現在的ISE儀器中都具備 。
3、ISE法雖然摒棄了基質效應的影響，但是血脂、不溶性蛋白質對電極的污染導致電極損耗的因素還是存在的。一般出現電極響應時 間延長，斜率偏低，直至失效。教科書中寫到：在25攝氏度時一價離子的理論斜率為59.16MV，二價離子為29.58MV。當 實際斜率測定值小于理論值70%時，應換掉電極，大于理論值的90%表示電極性能較好，越接近100%電極性能越好。
但直接法容易受潛在的標定偏差的影響，因為水溶性標準液和血清在電化學方面不相一致。可能是兩種方法測定結果存在偏差的主要原因 。
間接法對樣品的需求少，由于樣品預先進行稀釋，不易堵塞管道，降低了血脂，不溶性蛋白質對電極的污染，對電極的損耗也相應減少， 壽命延長．間接法測定的結果與被作為參考方法的火焰光度法測定結果具有良好的相關性和可比性，無需重新建立參考范圍．
文獻報道，健康人直接電位法比間接電位法或火焰光度計法約高２％～４％。有的廠家生產的直接法鈉鉀分析儀為了能與火焰光度計法測 得結果一致，設有血清水中鉀鈉數值與火焰光度計法數值相互校正的計算程序。如果選用這個程序，當樣品血清蛋白質和脂肪含量在正常 范圍內，直接電位法與火焰光度法數值相同，如為高血脂、高蛋白或低蛋白樣品，則二者結果將有差異。