EIS 可產生多價離子化的蛋白或多肽，允許相對分子質量達1×105 蛋白進行分析，分辨率在1500-2000amu。精確度在0.01%左右。EIS 更適合相對分子質量大的蛋白質的在線分析，且需要氣化或有機溶劑使樣品敏感化。利用EIS 與HPLC 聯合分離分析GH 和血紅蛋白均獲成功，其也可與CEZ 聯合應用。
