血液檢查
在卡他期末及痙咳早期白細胞計數高達（20～40）×109/L，最高可達100×109/L，分類淋巴細胞在60%以上，亦有高達90%以上者。
細菌培養
目前認為鼻咽拭培養法優于咳碟法。培養越早則陽性率越高，卡他期培養陽性率可達90%，發病第3～4周陽性率僅50%。在陣咳時或陣咳后采樣陽性率較高，若培養基中含青霉素可以減少其他細菌生長，更有利于疫咳桿菌的生長。
血清學檢查
（1）酶聯免疫吸附試驗：目前多采用疫咳桿菌毒素和絲狀血凝素作抗原來檢測疫咳特異性IgM抗體，可作為早期診斷，陽性率達70%。恢復期血清陽性率增高，尤其對細菌培養陰性者更有意義。
（2）酶聯斑點蛋白印跡法：采用抗疫咳毒素單克隆抗體進行酶聯斑點蛋白印跡法檢測疫咳患者鼻咽分泌物中疫咳毒素，特異性高，可作為早期診斷。
（3）單克隆抗體菌落印跡法：抗疫咳桿菌脂多糖和絲狀血凝素單克隆抗體菌落印跡ELISA檢測疫咳桿菌，48h即可在硝化纖維素膜上出現清晰藍色斑點陽性印跡反應，可作為早期診斷。
（4）熒光抗體法：應用鼻咽拭分泌物涂片，然后加上吸附熒光的高價疫咳抗血清，30min后在熒光顯微鏡下觀察病原菌，適用于快速診斷，早期患者75%～80%陽性，但有假陽性，故不能代替培養法。
聚合酶鏈反應(PCR)
檢查應用鼻咽吸出物進行PCR檢查，是一種快速、敏感性和特異性均很高的檢查疫咳抗原的方法。尤其是對非典型患者、病初用過抗生素者或者有過免疫接種者PCR檢查有重要價值。