癌癥eRNA表達圖譜并揭示其在癌癥臨床中的應用

　　2019年10月8日，德克薩斯大學休斯敦健康研究中心的韓冷、李文博課題組合作在Nature Communications上在線發表題為“Transcriptionallandscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted therapy incancer”的研究。該研究構建了迄今為止最完整的癌癥增強子RNA(eRNA)圖譜并揭示了eRNA在癌癥臨床中的潛在應用。

　　該項研究通過檢測eRNA在約1萬名癌癥病人及約1000個癌癥細胞系中的表達構建了目前為止最全面的癌癥eRNA圖譜，揭示了eRNA的癌癥特異性表達/癌癥種系特異性表達的特征，同時強調了eRNA作為生物標記物在不同類型癌癥臨床上的應用。通過研究eRNA與轉錄因子之間的共表達關系，發現eRNA的特異性表達與轉錄因子特異性調控密切相關。通過分析eRNA與編碼基因之間的基因組距離及表達相關性并結合多組Hi-C數據加以佐證，該研究構建了eRNA的調控網絡，揭示了eRNA在調控致癌信號通路及調節癌癥臨床治療基因中的關鍵作用。此外，該研究通過調查eRNA與抗癌化合物之間的關系，首次證實eRNA可影響癌癥細胞對抗癌藥物的敏感性和抵抗性，且該影響可能會關聯到相關的一條或多條癌癥信號通路。

　　這項研究拓展了該領域對癌癥基因轉錄調控的認知，探索了基于靶向eRNA的癌癥治療及聯合治療方案，開拓了癌癥治療新思路。