1.抗真菌作用
白芥子水浸劑（1:3）， 在試管內對堇色毛癬菌、許蘭氏黃癬菌等皮膚真菌有不同程度的抑制作用。
2.刺激作用
白芥子甙，本身無刺激作用，遇水后經白芥子酶的作用生成揮發性油（白芥子油）。
芥子揮發油有刺鼻辛辣味及刺激作用。應用于皮膚，有溫暖的感覺并使之發紅，甚至引起水泡、膿皰。通常將芥子粉除去脂肪油后做成芥子硬膏使用， 用作抗刺激劑（刺激性藥物使用于皮膚局部，其作用不僅限于用藥部位，并牽涉到其他部位，產生治療作用時， 稱為抗刺激作用），治療神經痛、風濕痛、胸膜炎及扭傷等。使用前先用溫水濕潤，以加強芥子酶的作用（沸水則抑制芥子酶的作用）。應用時間不超過15～30分鐘，皮膚敏感者只能應用5～10分鐘。
芥子粉作為調味劑， 使唾液分泌及淀粉酶活性增加，使心臟體積和心率減少。小量可刺激胃黏膜增加胃液及胰液的分泌，有時可緩解頑固性呃逆。內服大量可迅速引起嘔吐，可用于麻醉性藥物中毒之治療。
3.其他作用
白芥子甙水解物刺激胃黏膜，反射性引起支氣管分泌增加， 使痰液變稀而起祛痰作用。
家兔靜脈注射芥子生理鹽水浸出液，血壓先有輕度上升，后則下降， 呼吸增快。
亦有報告指出，給動物長期喂飼芥屬植物可使其甲狀腺腫大，此可能由于分泌了過多的促甲狀腺激素所引起。
白芥子 藥(毒)理學
本品所含的異硫氰酸芐酯對小鼠、豚鼠、大鼠腹腔注射的LD50分別為76-107，68及72mg/kg，口服的LD50分別為134，81及128mg/kg。