直腸后間隙膿腫屬于肛提肌以上深部膿腫,較為少見。多由肛腺膿腫向后穿破進入直腸后隙引起,也可由直腸炎、直腸潰瘍、直腸外傷引起。常見的致病菌有大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、鏈球菌和綠膿桿菌,偶有厭氧性細菌和結核桿菌,常是由多種病原菌混合感染引起的。