進行肛門指檢，有以下幾個方面的內容和意義：
1、首先要進行的是肛門括約肌和肛管直腸環的松緊度檢查，肛管直腸環是由內、外括約肌的上緣和恥骨直腸肌共同構成，圍繞肛管與直腸的交界處，內、外括約肌呈環狀，而恥骨直腸肌只在后面及兩側存在，故肛門指檢時，在肛管后方及兩側觸到，而在肛管前方不易觸到，肛門括約肌和肛管直腸環正常時食指能順利的伸入肛門內，如果食指通過困難或不能通過說明肛門有不同程度的狹窄，而如果肛門括約肌過于松弛無力，可能就會有肛門失禁了；
2、檢查肛管直腸前、后壁及其周圍有無觸痛、搏動、腫塊，并應注意腫塊的大小、硬度、活動性。對于位置較高的腫塊，可在蹲位或截石位作肛門指診，這兩種體位可使腫瘤下移，可捫到較高部位的直腸癌。必要時可做直腸與腹部雙合診或直腸與陰道雙合診檢查，對癌腫侵犯的范圍可提供有價值的資料；
3、在直腸前壁，男性可觸到前列腺，女性可觸及子宮頸，不應誤認為是病理腫塊；
4、檢查完畢手指抽出后，要看手指套上是否染有血跡或粘液，必要時應作涂片檢查。