1.視診
可見直腸陰道壁缺如、畸形，急性期局部紅腫，有時有分泌物溢出。
2.指診
直腸及陰道指檢可以確定瘺口的位置，同時可以檢查瘺口周圍組織有無瘢痕、狹窄等情況。
3.肛鏡或陰道窺器檢查
可直接觀察瘺口部位及大小。
4.B超
經直腸或者經陰道的腔內超聲適用于中低位的直腸陰道瘺，協助了解病變組織周圍的情況。
5.磁共振
多用于高位的直腸陰道瘺，可了解瘺管走形，與周圍組織及臟器的關系。
