適用于淺部、深部的真菌感染。直接鏡檢，陽性表示真菌的存在，但一般不能確定菌種。陰性不能完全排除。
異常結果：淺部真菌(癬菌)僅侵犯皮膚、毛發和指(趾)甲，而深部真菌能侵犯人體皮膚、黏膜、深部組織和內臟，甚至引起全身播散性感染。深部真菌感染腸道即表現為真菌性腸炎，可獨立存在如嬰兒念珠菌腸炎，或為全身性真菌感染的表現之一，如艾滋病并發播散性組織胞漿菌病。
需要檢查的人群： 有黏膜損傷，深部組織損傷，全身播散性感染，念珠菌腸炎，播散性組織胞漿菌病等癥狀者
