1.常見標本主要有各種分泌物，皮膚的角質性物質，如毛發、指(趾)甲、鱗屑，及膿汁液、穿刺液等，糞便和尿液，組織塊，環境中的各種標本材料等。
2.采集標本應新鮮，最多不超過2h，如不立即送檢則必須放入冰箱保存，盡速送檢；應在用藥前采集標本；標本采集量應充足，血液和腦脊液不少于5ml，胸腔積液不少于20ml，活體組織應采2份標本，1份送病理科、1份送鏡檢和培養。
3.對常見致病真菌應掌握的鑒定原則是首先區分酵母菌和霉菌。如在初代培養基上培養出酵母樣菌落，在鑒定前應進行分類純化。在排除細菌和其他真菌污染、區分混合感染后，對純菌落進行鑒定。
4.霉菌鑒定較為復雜，傳統鑒定方法主要依據分生孢子的個體發生過程結合其他特征進行鑒定。初代培養后根據形態學特征可鑒定至屬的水平，再依據不同真菌的鑒定要求，采用標準培養基和培養條件進一步完成菌種鑒定。目前真菌手工鑒定系統及自動化真菌鑒定系統正逐步應用于臨床。