1.急性期
一般表現術后1～3個月因大量腹瀉導致液體和電解質丟失，紊亂嚴重者危及病人生命，2～3周達高峰，每天從大便中丟失液體2.5～5升。除腹瀉外，尚有乏力、少尿及脫水、電解質缺乏、酸堿平衡紊亂、低鈣、低鎂、抽搐等表現。
2.適應期
適應階段：常延續數月至1年。該期腹瀉明顯減輕，水及電解質失衡有所緩解。臨床表現為營養不良性消瘦，嚴重者出現低蛋白血癥和水腫，也可因維生素和礦物質缺乏而出現夜盲癥、周圍神經炎、凝血障礙性出血傾向、貧血及骨軟化等。穩定期：一般經過術后1年左右時間才呈現穩定狀態。由于殘留的腸管已能最大限度地代償，病情逐漸穩定，可維持相對正常的家庭生活，但仍可能有脂溶性維生素鈣和其他微量元素缺乏的表現，回腸切除過多，患者可出現維生素B12的缺乏癥。部分病人不可能達到完全經口營養的階段，需借助于家庭胃腸外營養。