短腸綜合征是由于不同原因造成小腸吸收面積減少而引起的一個臨床癥候群，多由廣泛小腸切除、小腸短路手術造成保留腸管過少，營養物質的吸收障礙、腹瀉和營養障礙。嚴重者可危及病人生命。
1.成人
主要是由于腸系膜血管栓塞或血栓形成以及急性腸扭轉導致大范圍小腸切除。導致腸系膜血管栓塞或血栓形成的因素有：心衰、心臟瓣膜病變、動脈粥樣硬化、長期服用利尿劑及避孕藥、空回腸短路手術、腹部損傷、腸道腫瘤、醫源因素等。
2.兒童
出生前主要原因為小腸閉鎖，中腸旋轉不良導致的小腸異位固定或異常扭轉，新生兒期壞死性小腸炎。
出生后較少見的因素有先天性巨結腸病。