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近日,山東省農業科學院家禽研究所雞遺傳育種與繁育創新團隊完成的研究論文在《農業科學學報》(英文)(Journal of Integrative Agriculture,JIA) 正式發表。該研究基于山東地方雞種的基因組數據,篩選出在品種形成過程中受到選擇的基因,解析了山東地方雞種品種特異性表型的遺傳基礎。
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瑯琊雞。山東農科院供圖
雞肉作為我國第二大肉類消費品,是百姓膳食結構中動物性蛋白的主要來源之一。世界范圍內有不同品種、類型的雞,它們的品種特征各不相同,是寶貴的遺傳資源。中國雞遺傳資源極其豐富,為體型外貌、體重、繁殖、適應性等一系列重要性狀的精準鑒定提供了重要的素材。目前,對影響這些雞種特異性表型的遺傳決定因素的研究還有待進一步加深。深入了解品種特異性表型變異的潛在遺傳機制可以幫助育種者培育和改良雞品。
該研究對7個來自山東省的本地品種共140只雞和20只引進的隱性白羽雞的全基因組進行了重測序。基于常染色體單核苷酸多態性的群體基因組比較,揭示了雞群基于地理距離的聚類模式。研究確定了甲狀腺刺激激素受體 (繁殖性狀、生理節律)、紅細胞膜蛋白帶4.1樣1 (體型大小) 和烷基甘油單加氧酶 (攻擊行為) 是主要候選的雞品種特異性決定基因。此外,研究利用機器學習分類模型對雞的品種進行判別,預測準確率為92%,可有效實現萊蕪黑雞的品種鑒定。
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萊蕪黑雞。山東農科院供圖
該研究首次提供了山東地方雞種的完整基因組數據,相關分析揭示了山東地方雞種的地理模式和雞的品種特異性性狀相關的潛在的候選基因。該研究揭示的地方雞品種的遺傳基礎有助于更好地理解雞品種資源特性的內在機制。
山東省農業科學院家禽研究所雞遺傳育種與繁育創新團隊副研究員劉杰為論文通訊作者。研究由國家肉雞產業技術體系、山東省良種工程、山東省自然科學基金和山東省農業科學院農業科技創新項目資助。
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