其種類非常多，為方便起見，分為下列幾類：
（1）芳（香）基硫酸酯酶（arylsulfatase）（EC3．1．6．1）：一般作用于芳香硫酸酯的，如對硝基苯硫酸酯的酶。
（2）甾類硫酸酯酶（Steroid Sulfatase）（EC3．1．6．2）：如作用于硫酸酯等的雄（甾）酮硫酸等甾類的酶。
（3）葡糖硫酸酯酶（glycosulfatase）（EC3．1．6．3）：作用6-硫酸葡萄糖等的糖硫酸酯的酶。
（4）芥子硫酸酯酶（myrosulfatase）：作用于黑芥子硫苷酸鉀等的=N－O－SO3H鍵的酶。
（5）膽堿硫酸酯酶（Choline sulfafase）（Ee3．1．6．6）：作用于硫酸膽堿的酶。
（6）磺酰胺酯酶（sulfamatas）：作用于肝素的-NH－SO3H等的硫胺鍵的酶。
特別是（1）和（2）的酶用于合成底物的研究較多。關于自然底物是什么？
存在哪些種類的酶？尚有許多不清楚之處。但是，最近，在（1）的酶中有作用于天然硫酸（腦苷）脂（脂類的硫酸酯）和糖核苷（UDP－N-乙酰半乳糖胺-4-硫酸）的酶，另在（3）的酶中發現作用于硫酸軟骨素B的艾杜糖醛酸的硫酸基的酶。此外還知道，有好幾種遺傳性疾病是由于缺少這些酶的緣故，并越來越認識到在生物體內硫酸酯代謝的重要性。