堿性氨基酸(basic amino acid)指具有兩個氨基和一個羧基的氨基酸，在中性pH時具有凈正電荷。如賴氨酸、精氨酸、組氨酸 。其中賴氨酸屬于人體不能合成的八種必需的氨基酸之例，精氨酸為半必需氨基酸。堿性氨基酸在醫藥上具有很重要的價值，賴氨酸可以治療營養缺乏癥、發育不全及氮平衡失調癥，是重要的食品及飼料的強化劑，特別適用于兒童食品的制造。精氨酸與脫氧膽酸制成的復合制劑（明諾芬）是主治梅毒、病毒性黃疸等病的有效藥物。組氨酸可用于生產治療心臟病、貧血、風濕性關節炎和消化道潰瘍等的藥物 。
