堿性氨基酸在醫藥上具有重要的價值,賴氨酸可以治療營養缺乏癥、發育不全及氮平衡失調癥,是重要的食品及飼料強化劑,特別適于兒童食品的制造。精氨酸與脫氧膽酸制成的復合制劑(明諾芬)是主治梅毒、病毒性黃疸等病的有效藥物。