神經氨酸酶是流感治療藥物的作用靶點之一，自從人類了解該酶的作用之后，便開始了針對該酶抑制劑的研究，已經有兩種神經氨酸酶抑制劑上市，一種進入三期臨床研究。
在研的神經氨酸酶抑制劑根據結構可以分為唾液酸類似物、苯甲酸衍生物、環己烯衍生物、環戊烷衍生物、吡咯烷衍生物以及天然提取物六大類。這四大類抑制劑均以神經氨酸酶桶狀結構中心的保守序列為作用位點。在分子結構上多有一個環狀中心結構，構效關系研究顯示，環結構的大小和飽和程度對抑制劑活性影響很小，環上取代基的構型和電性是決定抑制劑活性的關鍵性質。
已經上市的神經氨酸酶抑制劑有葛蘭素史克的扎那米韋和羅氏的奧司他韋。