1、離心機使用時要放置在平穩、堅固的臺面上。
離心機的底座都裝有橡膠吸腳，借助于大氣壓力及儀器本身的重量，緊貼于臺面。大容量低速離心機和高速冷凍離心機要相應地安放在堅實的地面上，水平放置；超速離心機重達數百公斤，應放在很堅實的地面上并有防塵、防潮設備，保證離心室達到一定的真空度，正常運行。
2、離心機周圍必須保持750px以上的安全距離，且不得在離心機附近存放任何危險物品。
3、選擇合適的轉頭，控制轉頭的速度，轉速設定不得超過最高轉速。
在下述情況下要降低轉頭的最高轉速：
A）轉頭的運轉時間和運轉次數達到規定的壽命時；
B）轉頭受到局部表面損傷或出現管孔內輕微腐蝕時；
C）使用不銹鋼離心管、套管、厚壁管或離心瓶時；
D）樣品平均密度超過1.2g/cm3時；轉頭受到高溫時。
4、轉頭在每次使用前要嚴格檢查孔內是否有異物和污垢，以保持平衡。
A）轉頭必須保持干燥清潔，切勿碰撞擦傷。如不慎跌落，應對轉頭進行X
光拍片檢查，確認無內部損傷后方可繼續使用；
B）轉頭每次使用后應用溫水（50℃-60℃）及中性洗滌劑浸泡清洗，最后用蒸餾水或去離子水沖洗，軟布擦干后用電吹風烘干、上蠟，干燥保存。
5、各種離心管的拉力強度和伸長度都不同，應按需要選用。
A）離心管可由許多種不同材料制成，如聚乙烯、纖維素、聚碳酸酯、聚丙烯等。使用時注意保證樣品、溶劑及梯度材料不腐蝕離心管及蓋組件；
B）過期、老化、有裂紋或已受腐蝕的離心管盡量不用或降速使用；
C）控制塑料離心管的使用次數，注意規格配套。
6、離心管需對稱放置，且必須等量灌注樣品。注意離心管應只裝7成滿，雖然加有蓋子，但也可能因離心力太強而外泄。大部分離心管都附有蓋子，注意離心管的蓋子也要一起平衡，切不要使轉頭在不平衡的狀況下運行。
7、離心機一次運行最好不要超過60分鐘。
8、在離心過程中如發現異常現象，如不正常噪音及振動，應立即按STOP（而非關電源POWER）停機檢查，未找出原因前不得繼續運轉。在儀器使用過程中發生機器故障，部件損壞情況時要及時與技術人員聯系。
9、離心機運行過程中，不要開啟離心室蓋，不得用手或異物碰撞正在旋轉中的轉頭及離心管，也不要碰撞或移動離心機，或倚靠、坐靠離心機。
10、完成離心時，要等離心機完全靜止后，才能打開艙門，需盡快取出離心管。先觀察離心管是否完全沉淀以及沉淀位置。不管所要的是上層或沉淀，請取用干凈的燒杯收集上清，以免有誤。傾倒上清要小心，以免把沉淀一起倒出來；若不慎混在一起，就要重來一次。若離心管有漏，要找出原因，并盡快清理離心腔或離心艙。
11、機器使用完畢后，應做好清潔工作，保持機器的清潔。