目前農業部市場監管處有了明確規定：“農作物種子標簽二維碼必須滿足編碼規則第三條規定，每一個最小的出售單元需要對應唯一一個二維碼，而非一個產品使用同一個二維碼。”
常見的種子二維碼追溯系統賦碼有兩種途徑，一是在制作包裝時由包裝生產商一并賦碼，詞方式的優點在于種子生產企業避免設備投入及人工增加，缺點在于數據安全風險比較大，容易造成數據外露及被不法分子利用。二是在二維碼包裝（袋、盒、罐）做好后，農資生產企業自己進行賦碼，此途徑的優勢在于只要農資企業針對自家產品包裝類型選對標識設備，不但節約種子包裝二維碼賦碼成本，還可以有效避免數據丟失、二維碼盜用、信息泄露等不安全事件的發生。可變數據二維碼制作是技術含量較高的一步，需要由數據庫生成企業提供的數據與可以完成“一物一碼”賦碼的標識設備相匹配才可實現。數據完美轉換成相應的二維碼，附著在產品包裝上，以備檢驗、查詢、追溯。
不管是準備利用哪一種方式賦碼，在選購種子二維碼追溯系統的時候都需注意：
1、不要選擇免費產品-二維碼防偽系統是國家要求的實施方案，選擇的二維碼系統必須要有一定保障，否則后果無人承擔。
2、盡量避免通過三方代購-軟件的專業性非常強，沒有專業人員無法保障數據的安全。
3、擔心捆綁銷售。系統軟件和硬件沒有一對一的關系，種子二維碼追溯系統可以結合多種掃碼設備和噴碼設備，種子企業可根據需求自行選配硬件。