種子低溫標樣柜可以確保種子發芽率、活力等技術指標，從而達到安全高品質貯藏之目的。因此對于種子公司來說，也都愿意花費一定的成本在種子低溫標樣柜上面，因為它所能創造的價值，是遠遠要高于其成本的。因此近年來，使用種子低溫標樣柜的企業、學校和研究機構都在不斷攀升。但是由于種子的貯藏充分依賴種子低溫標樣柜，因此為了保證種子低溫標樣柜的正常運轉，達到安全儲藏的目的，種子低溫標樣柜的應用需要滿足以下的條件。
1.由于種子低溫標樣柜的運轉需要能夠提供穩定而長久的電力，因此在使用種子低溫標樣柜之前，應用的地區一定要配備基本的配電設施，如電源容量、供電形式等，同時要避免斷電對種子低溫標樣柜，要有必要的應急電源。
2.種子低溫標樣柜不同于種子低溫儲藏庫，其所能保存的種子數量是有限的，因此在使用種子低溫標樣柜之前，一定要想明確自身的需求，確定種子低溫標樣柜是否能夠滿足種子保存的需要，避免估計錯誤造成的麻煩和問題。
3.種子低溫標樣柜對于保存種子的品種、數量以及期限都是有要求的，因此在應用種子低溫標樣柜之前，一定想要了解該儀器的功能特點，以及適用范圍，以保證種子低溫標樣柜所提供的條件能滿足自身發展的需要。
4.種子在進入種子低溫標樣柜保存之前，要進行水分測定，保證待儲藏的種子水分含量是在標準以下的，這也種子低溫標樣柜才能保證儲藏的效果和品質。
種子低溫標樣柜進行種子貯藏的基本原理就是在低溫、干燥的條件下，盡量降低種子的呼吸強度，減少營養消耗，從而保持種子的生命力，這一點需要使用者知曉。