種子脫粒機是現代農業育種研究中非常重要的一款種子脫粒設備，它的應用能夠有效提高種子脫粒的效率，縮短農業育種的周期。而種子脫粒機具有良好的脫粒效果，不僅分離效果好，脫粒方便，對種子損失小，而且方便清掃。不過種子脫粒機要想達到理想的脫粒效果，并不是開機運行就可以了，控制種子脫粒機的速度是其中一項非常重要的內容。
實際上種子脫粒機的速度與其脫粒的清潔度及工作效率息息相關，同時也會影響到種子脫粒機的壽命，因此在使用種子脫粒機進行種子脫粒的時候，一定要將其速度控制在合適的范圍內，調節速度要根據操作規范或說明書要求來進行操作，切不可任意提高轉速。
種子脫粒機的速度一般來說既不宜過快，也不宜過慢，要按照說明書中規定的轉速進行設置，這是因為如果轉速過高，不但脫粒速度不快，反而會出現籽粒破碎嚴重、機器使用壽命縮短、不安全因素增加等不利情況出現，也就是說會直接影響種子脫粒機的脫粒效果，進而對育種研究工作造成影響，因此合理控制種子脫粒機的速度非常重要。
針對于不同種類的種子脫粒，種子脫粒機所要求的轉速是不一樣的，比如一般脫小麥為28-32米/秒，秈稻為24-26米/秒，粳稻為26-30米/秒。在進行脫粒的時候，要根據當前脫粒谷物的種類來正確選擇合適的轉速，這樣才能發揮出種子脫粒機正常的脫粒效果，保持脫粒后的種子的清潔度，為下一步的育種研究工作提供真實有效的依據。