種子健康檢測是種子品質檢測工作中的一項重要內容，其主要的目的是檢測檢疫性傳染病害；確定種子批的使用價值；評定種子批是否需要經過種子處理，以及處理后的效果；為調查或研究目的而評估某種傳染病的流行情況；探明發芽率低的原因，彌補發芽試驗的不足。而現在借助種子X光機，可以更加便捷的開展種子健康檢查，提供種子的品質和生產效益。
一般來說，種子健康測定的要求是測定測定種子是否攜帶有病原菌(如真菌、細菌及病毒)、有害的動物(如線蟲及害蟲)等健康狀況。即對種子所攜帶病蟲害種類及數量進行檢測。其中種傳病害是指在病毒侵染循環中的某一階段和種子聯系在一起，其病原物附著、寄生或存在于種子表面和內部，或混雜于種子中間，主要通過種子攜帶而傳播的一類植物病害。種子害蟲則是指在種子田間生長和貯藏期間，感染和危害種子的害蟲。
以往在進行種子健康檢測的時候，往往只是集中在其表面，也就是通過肉眼觀察其健康情況，但是這種方式比較粗放，以往也曾出現表面觀察種子品質良好，但是投入生產之后，卻發現種子發芽率低，通過使用鑷子打開種子內部檢測之后發現，種子內部存在蟲洞或是有內部蟲害，因此現代種子健康檢測中不僅需要觀察其外部特征，還需要使用種子X光機來檢查種子的飽滿粒、空粒和畸形粒，測定種子的活力、成熟期以及種子內部的蟲害等。
種子X光機在種子健康檢測中的應用，第一點來說是可以避免對種子的破壞，保持種子的完整性，其次是通過拍攝X光片，可以清楚的看到種子內部的特征情況，避免了將有害或者是無效的種子用于農業生產，大大減輕種傳病害的發生，降低了由此造成的農業生產風險，而且借助種子X光機進行種子健康測定，了解了病原菌的感染情況和程度，則可有針對性采取措施對種子進行處理，效果更為顯著。