6月1日，由中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所李亦學研究組、美國密歇根大學醫學中心和日本山梨大學分子病理系等單位研究人員合作完成的論文“Hyperlipidemia-associated gene variations and expression patterns revealed by whole-genome and transcriptome sequencing of rabbit models”在線發表于Scientific Reports 雜志。這項工作通過高通量測序，首次系統揭示了高脂血癥和動脈粥樣硬化家兔模型在基因組和轉錄組上的獨特特征。
家兔是生物醫學研究中的一種重要模式生物。相比于大小鼠，家兔的脂代謝特征與人類更加接近。研究人員對三種最常用的實驗家兔品系，包括新西蘭白兔（NZW）、日本白兔（JW）和渡邊可遺傳性高脂血癥家兔（WHHL）進行了全基因組測序。群體遺傳分析表明WHHL的遺傳多樣性最低，但卻積累了最高比例的高頻有害突變。除了已知的LDLR缺陷以外，其他一些高頻有害突變可能也與WHHL的病理表型相關。研究人員同時對WHHL和高膽固醇飲食喂養的NZW中的相關組織開展了轉錄組測序。比較發現，這兩種家兔模型雖然高膽固醇血癥的類型不同，但主動脈病變卻顯示了類似的表達譜。然而，肝臟的表達譜僅在高膽固醇喂養的NZW，而不在WHHL中顯示出炎癥反應和異常的脂代謝。這些結果為合理選擇家兔模型提供了重要依據，同時也為脂代謝和相關心血管疾病的分子機制研究提供了新的啟示。
這項工作在李亦學的指導和協調下完成，得到了科技部、國家自然科學基金委、中國科學院、美國國立衛生研究院等項目經費的支持。
WHHL中高頻有害突變篩選
WHHL和高膽固醇飲食NZW的表達譜比較
在國家自然科學基金項目（批準號：32125009、32430017）等資助下，西安交通大學葉凱團隊在基因組三維結構演化領域取得新進展。研究團隊創建了染色質長距離互作捕捉計算方法和跨物種分析手段，首次勾......
自21世紀初具有里程碑意義的人類基因組解碼工作完成以來，DNA測序技術迎來了爆發式發展。傳統計算機已難以滿足海量的數據與激增的算力需求，這推動人們尋求替代方案。如今，量子計算距離實用又近了一步。科學家......
南亞地區的人們以酸奶、印度奶酪和印度酥油等乳制品為食。現在，這一地區正幫助解開一個長期存在的謎題：人類是如何獲得消化牛奶的能力的。一項針對印度、巴基斯坦和孟加拉國現代及古代人類基因組的研究表明，一種能......
一項發表在最新一期《自然》雜志上的研究，通過對生活在10200至150年前的南非個體基因組進行分析，證實了在南部非洲，一群智人在半隔離的狀態下生活了數十萬年。這是迄今規模最大的對非洲古代DNA的研究，......
步行模式不同，對健康的影響也大不同。一項最近發表于《內科醫學年鑒》的研究揭示，持續的步行訓練比零散的活動更能為心臟提供更強的保護。來自澳大利亞悉尼大學和西班牙歐洲大學的研究人員發現，與只短暫步行不到五......
? 在美國人類遺傳學會（ASHG）年會上，因美納5堿基解決方案的早期試用客戶——倫敦健康科學中心研究所將展示該技術在加速罕見病病例解析方面的強大潛力。? 因美納專有的5堿基化學技術......
人類基因組中存在大量具有"跳躍"能力的逆轉座子（retrotransposon）序列。在胚胎發育早期、免疫和神經系統等特定階段和環境下，它們會被激活，發揮重要生理功能；在病毒感染、......
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）高遠團隊與動物研究所趙方慶團隊，開發出面向TB級轉錄組數據的高效環形RNA檢測與定量工具CIRI3，通過反向剪接序列比對與跨樣本整合算法設計，實現了......
圖轉錄組光催化標記技術CAT-seq及同步多組學光催化標記技術CAT-ortho在國家自然科學基金項目（批準號：22222701、92478119、22321005、92253301）等資助下，北京大......
橡膠樹是天然橡膠的主要來源。“橡膠樹育種面臨的主要困難在于周期長和效率低，通過常規育種方法將多抗、高產性狀聚合往往需要30~40年。”中國熱帶農業科學院橡膠研究所研究員程漢告訴《中國科學報》。然而，目......