科學家破譯枸杞子基因組圖譜

枸杞作為傳統的藥食同源植物，含有豐富的果膠多糖。枸杞果膠多糖（LBPPs）是重要的生物活性成分，具有抗氧化、免疫調節、抗衰老等功效。盡管枸杞在健康領域應用較多，但對枸杞的遺傳圖譜、枸杞活性成份LBPPs的合成過程和調控機制知之甚少。這在很大程度上制約了枸杞的分子育種發展與推廣。

近日，中國科學院院士、生物物理研究所研究員陳潤生研究組與研究員陳暢研究組，在《基因組蛋白質組與生物信息學報》（Genomics,?Proteomics & Bioinformatics）上發表了題為Enzymes Repertoires and Genomic Insights into Lycium Barbarum Pectin Polysaccharides Biosynthesis的研究論文。該研究解析了枸杞基因組圖譜及活性成分，揭示了LBPPs的完整生物合成途徑，并鑒定了關鍵合成酶及糖代謝調控相關的RNA。

該研究基于三代測序技術、光學圖譜技術、自研高效三維基因組捕獲技術等方法，對枸杞進行de novo的基因組組裝，突破枸杞基因組高雜合、高重復的瓶頸，獲得枸杞高精度基因組圖譜。在此基礎上，研究解析了多糖活性酶基因庫CAZymes在LBPPs合成中的核心作用，尤其是在枸杞果膠多糖骨架延伸、側鏈合成和鏈修飾等方面的累積擴張。進一步，研究鑒定了一個關鍵鼠李糖糖基轉移酶基因RRT3020。研究顯示，RRT3020能夠顯著促進枸杞果膠多糖生成。同時，該研究解析了與枸杞果膠多糖代謝相關的長鏈非編碼RNA，為剖析基因調控提供了新視角。該研究在枸杞中建立了全面的果膠多糖合成模型，揭示了從糖轉運到多糖修飾的整個合成過程。

研究工作得到國家重點研發計劃、國家自然科學基金、寧夏回族自治區重點研發計劃的支持。