1、水稻重金屬(一般是汞)超標的原因主要是因為灌溉水稻的水質中含有較多重金屬，長期灌溉后就會導致重金屬在十壤的表層積累，被水稻吸收后就會造成水稻重金屬超標。十壤中的含汞量會隨著灌溉水中汞的濃度增加而增加，一般隨灌溉水進入土壤中的汞主要集中在土壤表層0-5cm的地方。
2、大量重金屬進入農田土壤后，由于不能降解也無法遷出，逐步堆積后就會對土壤的理化性質和生物特性造成不良影響，同時也會危害土壤中的生物群體。
3、全屬污熱還會對農作物造成直接傷害，導致農作物生長不良，其至可能造成農作物死亡，受到污染的農出出產的農作物其重金屬超標，作物質量安全也會比較低。