單發性肝囊腫生長緩慢，多數病人無明顯癥狀。當囊腫長大到一定程度時，可壓迫鄰近臟器，如胃、十二指腸和結腸等，常見有食后飽脹、食欲差、惡心、嘔吐，右上腹部不適和隱痛等癥狀。若囊腫增大壓迫膽總管則有黃疸，破裂可有囊內出血，帶蒂囊腫扭轉可有急性腹痛；肝腫大但無壓痛，約半數患者有腎、脾、卵巢、肺等多囊性病變。
肝囊腫是指非寄生蟲性的肝臟局部組織呈囊性腫大。潴留性肝囊腫為肝內某個膽小管堵塞，引起分泌增多及膽汁潴留而造成，囊腫多為單發性；先天性肝囊腫多無膽汁郁滯，呈多發性，常伴有腎臟或其他臟器的多囊癥。
